ДПП ПК «Анализ NGS данных» разработана рабочей группой сотрудников кафедры биоинформатики МБФ ФГАОУ ВО РНИМУ им. Н.И. Пирогова Минздрава России, под руководством зав. кафедрой А.А. Лагунина.
Программа направлена на получение основополагающих знаний и практических навыков в области анализа данных высокопроизводительного секвенирования (NGS данных). В первом разделе обучающиеся получают навыки работы в операционной системе Linux. Во втором разделе изучают основные форматы файлов, используемых при анализе NGS данных, методы, источники данных и программные средства, используемые в анализе NGS данных. Третий раздел программы посвящен анализ RNA-Seq данных от сырых данных, выдаваемых секвенатором до анализа обогащения дифференциальной экспрессии генов по их функциональной принадлежности. Четвертый раздел посвящен анализу результатов секвенирования в эпигенетических исследованиях и включает анализ данных бисульфитного секвенирования и анализ данных ChIP-Seq. Цель освоения программы — получение базовых знаний и навыков в анализе данных высокопроизводительного секвенирования, включая анализ геномных, транскриптомных и эпигенетических данных, полученных с использованием DNA-seq, RNA-seq, ChIP-seq и бисульфитного секвенирования. Программа содержит 18 четырехчасовых практических занятия на персональных компьютерах, подключенных к сети Интернет.
По результатам освоения программы повышения квалификации и успешного прохождения итоговой аттестации выдаётся удостоверение о повышения квалификации установленного образца.
